Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Clec18aQ7TSQ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Clec18aQ7TSQ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms