Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc93Q7TQK5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms