Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actn1Q7TPR4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms