Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap1s3Q7TN05 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms