Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox11Q7M6Y2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms