Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Higd1cQ76I25 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms