Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sned1Q70E20 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sned1Q70E20 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms