Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpv1Q704Y3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpv1Q704Y3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpv1Q704Y3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpv1Q704Y3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpv1Q704Y3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpv1Q704Y3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms