Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms