Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms