Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf653Q6YND2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf653Q6YND2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms