Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc57Q6PHN1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc57Q6PHN1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms