Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med16Q6PGF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms