Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gramd2bQ6PEM6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gramd2bQ6PEM6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gramd2bQ6PEM6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gramd2bQ6PEM6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gramd2bQ6PEM6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gramd2bQ6PEM6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gramd2bQ6PEM6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gramd2bQ6PEM6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms