Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfrlQ6PE55 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms