Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms