Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms