Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc36Q6PDM4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms