Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms