Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvoplQ6PDF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SvoplQ6PDF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms