Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trak1Q6PD31 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms