Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhb9Q6PB60 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhb9Q6PB60 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms