Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg2aQ6P4T0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms