Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms