Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Casc4Q6P2L7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc4Q6P2L7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms