Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slx4Q6P1D7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms