Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms