Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pprc1Q6NZN1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms