Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms