Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Colgalt2Q6NVG7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms