Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms