Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SphkapQ6NSW3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms