Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms