Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KdsrQ6GV12 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KdsrQ6GV12 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms