Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms