Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil1Q6EDY6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms