Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lemd2Q6DVA0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms