Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms