Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Usp7Q6A4J8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp7Q6A4J8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Usp7Q6A4J8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Usp7Q6A4J8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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