Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thsd7aQ69ZU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Thsd7aQ69ZU6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms