Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms