Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Samd9lQ69Z37 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd9lQ69Z37 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Samd9lQ69Z37 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms