Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn2Q68FG2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms