Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms