Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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