Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tbr1Q64336 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tbr1Q64336 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tbr1Q64336 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tbr1Q64336 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tbr1Q64336 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tbr1Q64336 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tbr1Q64336 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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