Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf4Q64310 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Surf4Q64310 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms