Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp1Q62442 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms