Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa13Q62424 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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