Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tff3Q62395 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tff3Q62395 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tff3Q62395 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tff3Q62395 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tff3Q62395 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tff3Q62395 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tff3Q62395 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tff3Q62395 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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